Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim23Q9DAL0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms