Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sgf29Q9DA08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sgf29Q9DA08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sgf29Q9DA08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms