Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9R3

Spata9, Spermatogenesis-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata9Q9D9R3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spata9Q9D9R3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata9Q9D9R3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spata9Q9D9R3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms