Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmd12Q9D8W5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms