Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D8N1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D8N1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8N1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D8N1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8N1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8N1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8N1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms