Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms