Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D7E4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D7E4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms