Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf225Q9D7D1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf225Q9D7D1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf225Q9D7D1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf225Q9D7D1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms