Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Necab3Q9D6J4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Necab3Q9D6J4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms