Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp4Q9D4F8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp4Q9D4F8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms