Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus10Q9D3U0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus10Q9D3U0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms