Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pramef12Q9D2F1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef12Q9D2F1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef12Q9D2F1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms