Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Serpinb3bQ9D1Q5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Serpinb3bQ9D1Q5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Serpinb3bQ9D1Q5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serpinb3bQ9D1Q5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms