Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D1K7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D1K7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D1K7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1K7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1K7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms