Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SarnpQ9D1J3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms