Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdca7Q9D0M2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdca7Q9D0M2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca7Q9D0M2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca7Q9D0M2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca7Q9D0M2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca7Q9D0M2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca7Q9D0M2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms