Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1206.5 ms