Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp11Q9CZJ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Utp11Q9CZJ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms