Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih4Q9CX13 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Cnih4Q9CX13 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih4Q9CX13 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Cnih4Q9CX13 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cnih4Q9CX13 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cnih4Q9CX13 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cnih4Q9CX13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Cnih4Q9CX13 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnih4Q9CX13 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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