Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms