Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem42Q9CR22 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem42Q9CR22 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem42Q9CR22 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem42Q9CR22 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem42Q9CR22 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem42Q9CR22 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem42Q9CR22 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem42Q9CR22 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem42Q9CR22 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms