Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znhit3Q9CQK1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znhit3Q9CQK1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms