Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufb5Q9CQH3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb5Q9CQH3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms