Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700029P11RikQ9CQ68 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms