Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf8Q99PV0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms