Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim11Q99PQ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim11Q99PQ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim11Q99PQ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms