Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH2

Pard3, Partitioning defective 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3Q99NH2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pard3Q99NH2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pard3Q99NH2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pard3Q99NH2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pard3Q99NH2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pard3Q99NH2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pard3Q99NH2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pard3Q99NH2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pard3Q99NH2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pard3Q99NH2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pard3Q99NH2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms