Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcgf6Q99NA9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pcgf6Q99NA9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcgf6Q99NA9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms