Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd1Q99MV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd1Q99MV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms