Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs1Q99MS8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpgs1Q99MS8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms