Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SrrtQ99MR6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrrtQ99MR6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms