Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp4Q99ME9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp4Q99ME9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp4Q99ME9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp4Q99ME9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms