Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Atp1b4Q99ME6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Atp1b4Q99ME6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp1b4Q99ME6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atp1b4Q99ME6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms