Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d1Q99MB3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm2d1Q99MB3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms