Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smtnl1Q99LM3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smtnl1Q99LM3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smtnl1Q99LM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms