Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf34Q99KR6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf34Q99KR6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms