Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me2Q99KE1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me2Q99KE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Me2Q99KE1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms