Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdxdc1Q99K01 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdxdc1Q99K01 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdxdc1Q99K01 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms