Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdcbp2Q99JZ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdcbp2Q99JZ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms