Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Taf11Q99JX1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf11Q99JX1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf11Q99JX1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms