Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlcd1Q99JT6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tlcd1Q99JT6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlcd1Q99JT6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms