Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrcc4Q924T3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc4Q924T3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrcc4Q924T3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc4Q924T3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms