Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Spdl1Q923A2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdl1Q923A2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms