Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubb6Q922F4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb6Q922F4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms