Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek8Q91ZR4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Nek8Q91ZR4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek8Q91ZR4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms