Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha12Q91Y18 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdha12Q91Y18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha12Q91Y18 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms