Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha7Q91Y13 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha7Q91Y13 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha7Q91Y13 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms