Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y00

Pcdhb2, Protocadherin beta 2, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb2Q91Y00 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb2Q91Y00 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb2Q91Y00 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms