Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rrp9Q91WM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrp9Q91WM3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms