Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc44a4Q91VA1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc44a4Q91VA1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a4Q91VA1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms